截至2025年2月，复旦大学共拥有 18家附属医院，具体分类如下：

综合医院

- 复旦大学附属中山医院

- 复旦大学附属华山医院

- 复旦大学附属华东医院

- 复旦大学附属金山医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属公共卫生临床中心

- 复旦大学附属质子重离子医院

- 复旦大学附属精卫中心（筹）

专科医院

- 复旦大学附属肿瘤医院

- 复旦大学附属儿科医院

- 复旦大学附属妇产科医院

- 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院

- 复旦大学附属公共卫生临床中心

- 复旦大学附属质子重离子医院

- 复旦大学附属精卫中心（筹）

区级医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

- 复旦大学附属第五人民医院

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- 复旦大学附属第五人民医院